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3730/3730xl基因分析仪如何做光谱校正(Spectral Calibration)?

为了校准信号重叠,需知道一种荧光信号在其他荧光信号处产生的重叠系数。
Oct 29th,2026 7 浏览量
一、什么是光谱校正?

DNA会被不同的荧光素标记,不同的荧光素组合称为染料组(Dye Set)。从下图可以看到,四(或五)色荧光检测系统的本质是检测四(或五)种荧光素在其中心发射波长处的信号。由于每一种荧光素的发射光谱不是锐线光谱,而是一种有一定宽度分布的光谱带。所以一种纯荧光除在它自己光谱的中心波长处能采集到信号N1外,在其他荧光信号光谱的中心波长处亦能检测到信号而产生信号重叠。为了校准信号重叠,需知道一种荧光信号在其他荧光信号处产生的重叠系数。所以,我们用不同长度的DNA片段分别标记上不同的荧光素来计算这些系数。最后得到一个4 x 4(或5 x 5)的数据矩阵(Matrix)。

光谱校正,又称为Matrix校正。
二、何时做光谱校正?

    • 使用了新的荧光染料 。
    • 激光系统或CCD在工程师调节或更换后 。
    • 实验结果中出现不同颜色的荧光干扰(有拔起或下压峰) 。
    • 参数的改变(荧光类型Dye Set,毛细管类型50cm/36cm) 。

      注:仅仅更换同种类型的毛细管,无需光谱校正

三、不同的Dye Set如何选取试剂?

注:

* 如果不同样品间,峰高差异很大时,推荐使用Any4Dye-HDR,否则使用Any4Dye。
** 如果是3730xl,推荐使用G5-RCT;如果是3730,G5和G5-RCT均可使用。

其他实验试剂请联系试剂厂商了解相应Dye Set及相应光谱校正试剂

 四、样品准备

    • 照试剂盒说明书,用Hi-Di甲酰氨混合校正标准品 。
    • 震荡离心 。
    • 95ºC变性5分钟后立即冰浴2分钟 。
    • 震荡离心 。

如下图D-1

    • 在96或384孔板中分装样品(96孔板10μl/孔连续加样,384孔板5μl/孔隔行加样) 。

如下图D-2

    • 使用橡胶垫装配样品板,装配后橡胶垫必须平整。样品板上的孔与橡胶垫上的孔要对齐(如使用热封膜,请参考相关封膜机手册) 。

如下图D-3

    • 简单离心,比如<1500g,5秒 。
    • 确认所有孔的样品都在底部 。

如下图D-4

    • 按下图组装上样组件。

注意:

  1. 组装灰色橡胶垫和样品板的时候,注意样品板上的孔与橡胶垫上的孔要对齐,不要有拱起或压扁。
  2. 组装灰色橡胶垫和白色固定器的时候,注意橡胶垫于固定器上进样孔要对齐,否则会损坏毛细管。

五、创建光谱校正Instrument Protocol

六、设置光谱校正板(Plate)

  

七、载入光谱校正板

八、运行光谱校正

 

 

九、确认光谱校正成功/失败

 

十、光谱校正失败了怎么办?

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